Стюарт теперь учится в школе, но ему не с кем играть, поскольку у Джорджа появился новый друг — чернокожий паренёк Уилл. Но очень скоро всё меняется, когда Стюарт знакомится с канарейкой по имени Маргало. Они становятся лучшими друзьями, но у птички есть секрет от друга: злобный Сокол, от которого он её спас, на самом деле её опекун, и в обмен на это она крадёт для него драгоценности. Вскоре ей приходится похитить кольцомамы Стюарта,...

В 2002 году Sony Computer Entertainment Europe и Magenta Software была разработана и выпущена видеоигра для PlayStation Stuart Little 2. Сюжет видеоигры практически полностью повторяет сюжет фильма.